Hlavními vyučovanými předměty v oblasti agrosystémů jsou Obecná produkce rostlinná, Herbologie, Systémy rostlinné výroby, Zemědělské systémy a Zemědělství. Tyto jsou následně rozvíjeny ve specializovaných předmětech Ekologické zemědělství, Precizní zemědělství, Minimalizace zpracování půdy, Dotace pro zemědělství a venkov, Aplikovaný zemědělský software, Alternativní hospodaření na zemědělské půdě, Produkční systémy rostlinné výroby, Rostlinná výroba pro jakost, Základy rostlinné produkce tropů a subtropů a Historie zemědělství.
V bioklimatickém směru jsou hlavními předměty Bioklimatologie a Agroklimatologie s navazujícím předměty Aplikovaná bioklimatologie a Změna klimatu. Většina uvedených předmětů je dle potřeby vyučována i v anglickém jazyce.
Součástí výuky jsou terénní cvičení a exkurze do předních zemědělských podniků v prvovýrobě a institucí provádějících výzkum v oblasti rostlinné produkce.